DeutschesFachbuch.de : Mathematik im Labor Ein Arbeitsbuch für Molekularbiologie und Biotechnologie Von Frank H. Stephenson

INHALTSVERZEICHNIS | öffnen

Inhaltsverzeichnis
Vorwort XI
1 Wissenschaftliche Notation und metrische Vorsilben 1
Einleitung 1
Signifikante Stellen 1
Runden signifikanter Stellen bei Berechnungen 2
Exponenten und wissenschaftliche Notation 3
Ausdrücken von Zahlen in wissenschaftlicher Notation 4
Umwandlung von Zahlen aus der wissenschaftlichen Notation in Dezimalnotation 6
Addieren und Subtrahieren in wissenschaftlicher Notation geschriebener Zahlen 7
Multiplizieren und Dividieren in wissenschaftlicher Notation geschriebener Zahlen 8
Metrische Vorsilben 12
Umrechnungsfaktoren und Kürzen von Ausdrücken 12
2 Lösungen, Gemische und Medien 16
Einleitung 16
Berechnung von Verdünnungen: Ein allgemeiner Ansatz 16
Konzentration um einen Faktor X 18
Herstellung in Prozent angegebener Lösungen 20
Verdünnen in Prozent angegebener Lösungen 21
Mol und Molekülmasse: Definitionen 25
Molarität 26
Verdünnen molarer Lösungen 28
Umwandlung von Molarität in Prozent 29
Umwandlung von Prozent in Molarität 30
Normalität 31
pH 32
3 Zellwachstum 38
Die bakterielle Wachstumskurve 38
Arbeiten mit der Zellkonzentration 42
Auftragen der OD 550 gegen die Zeit im linearen Koordinatensystem 44
Auftragen des Logarithmus der OD 550 gegen die Zeit im linearen Koordinatensystem 4...
Berechnung der Generationszeit 47
Auftragen von Zellwachstumsdaten im halblogarithmischen Koordinatensystem 50
Direkte Bestimmung der Generationszeit durch Auftragen der Zellkonzentration gegen di...
Auftragen der Zelldichte gegen die OD 550 im halblogarithmischen Koordinatensystem ...
Der Fluktuationstest 56
Beispiel für einen Fluktuationstest 57
Varianz 59
Messen der Mutationsrate 61
Bestimmung der Mutationsrate auf Agarplatten 68
Messen der Zellkonzentration im Hämocytometer 70
4 Arbeiten mit Bakteriophagen 71
Einleitung 71
Multiplizität der Infektion 71
Wahrscheinlichkeiten und Multiplizität der Infektion 73
Messen des Phagentiters 79
Verdünnen von Bakteriophagen 80
Messen des Phagenertrags 82
5 Quantitative Bestimmung von Nucleinsäuren 85
Quantitative Bestimmung von Nucleinsäuren mittels UV-Spektroskopie 85
Bestimmung der Konzentration doppelsträngiger DNA 86
Berechnung der Konzentration doppelsträngiger DNA mittels Absorption und Extinktionsk...
Berechnung einer millimolaren (mM) DNA-Konzentration 90
Bestimmung der Konzentration einzelsträngiger DNA-Moleküle 91
Quantifizierung von Oligonucleotiden 94
Messen von RNA-Konzentrationen 98
Molekülmasse, Molarität und Nucleinsäurelänge 98
Abschätzen der DNA-Konzentration auf einem Ethidiumbromidgel 102
6 Markierung von Nucleinsäuren mit Radioisotopen 103
Einleitung 103
Einheiten zur Messung der Radioaktivität: das Curie 103
Abschätzung der Plasmidkopienzahl 104
Markierung von DNA mittels Nick-Translation 106
Markierung von DNA mit zufallsgemäß erzeugten Primern (Random Primer Labeling) 108
Markierung von 3'-Enden mit Terminaler Transferase 112
cDNA-Synthese 114
Homopolymer-Tailing 120
In vitro-Transkription 124
7 Oligonucleotidsynthese 127
Einleitung 127
[weiter lesen]

REGISTER | öffnen

Index
Aabhängige Variable 166
Absorption 39, 51, 85-87, 89, 93, 96, 130, 225 f., 228, 231-234, 237, 239
Absorptionskoeffizient 89, 226, 228
Absorptionskonstante 89
Absterbephase 44
Addition 23
Aminosäureeinbau 245
Amplicons 136
Amplifikation 134, 136, 141 f., 159
Annealing (PCR) 134, 148
Antilog(arithmus) 34, 50, 62, 139 Äquivalenzpunkt 162, 170
Assoziativgesetz der Multiplikation 9
Atto 12
Ausbeute pro Schritt (Oligonucleotidsynthese) 130 f.
Avogadro-Zahl 25
B ß-Galactosidase 197, 225, 228, 236-239
bakterielle Wachstumskurve 38
Bakteriophagen 56, 71 84
Bakteriophage Lambda 71, 74, 79, 102, 180-182, 187-189
Bakteriophagenverdünnung 79 f.
Bakteriophage Tl 56, 79
Base 35
Basis 3, 32 f., 45
Beersches Gesetz 89 best fit 166, 214
Bestimmtheitsmaß 171
Bibliothek (Bank)
- cDNA 196 f.
- genomische 182, 195
- Screening 199
- Expressionsbank 197
Bradford-Test 234
CCAT-Test 241, 244
cDNA 114 f., 117 f., 161 f.
cDNA-Banken 196 f.
cDNA-Synthese 114 f., 117-119
Codons 203 f.
Concatemer 182, 189
Coomassie Brilliant Blue 234
Counts pro Minute (cpm) 103
Curie 103
DDalton 92
dekadischer Logarithmus 32, 45, 139
Deletionen, verschachtelte 220
Denaturierung 134, 142
Desoxynucleosidtriphosphate 134, 155
Detritylierung 127, 130
Dezimalform 6, 62
Dimensionsanalyse 17 f.
Division 19
DMT-Kationen-Test 130
DNA
- einzelsträngige, Konzentration 91-93
- Größenbestimmung 209
- Konzentration auf Ethidiumbromidgel 102
- Markierung mit Nick-Translation 106-109
DNA-Polymerase 106, 134, 158-160, 196
- Fehlerrate bei PCR 159
DNA-Sonde 199, 208
dNTPs 103, 106-109, 114-119, 121 f., 155-157 dpm 103 f.
EEcoRl 178 f., 180
einzelsträngige DNA (ssDNA) 91-94, 101 f., 196
Enthalpie 150 f.
Enthalpieänderung, ΔH° 150
Enthalpiebeitrag (ΔH°e) 152
Erststrang-cDNA-Synthese 114 f., 118 f.
Escherichia coli 56, 174
Ethidiumbromid 102, 161 f.
Exponent 3, 5-7, 9-11, 14, 32 f., 45
Exponentengesetze 8 exponentielle Amplifikation 136
Expressionsbanken 197
Extensionsschritt 134
Extinktion (PCR) 87
- Extinktionskoeffizient 89, 95 f., 226-229
- DNA-Basen 96
- Oligonucleotide 95
FFehlerrate der DNA-Polymerase 159
Femto 12
Fluktuationstest 56 f., 61 f., 64
Formelmasse 25
Fragment-Enden 177
freie Energie 150-152
FW 25
Gg-Kraft 248, 250
G/C-Gehalt 149
Gelelektrophorese 161, 209
Generationszeit 47, 49, 51 f., 54
genetischer Code 204
Genexpression 236
genomische Bank 182, 195
Genspleißen 174
Gesamtausbeute 130 f.
Giga 12
Gleichheit bei der Addition 23
Gleichheit bei der Multiplikation 19
Glucose 20, 25, 236
Hhalblogarithmisches Koordinatensystem 50-52, 54 f., 215
Hämocytometer 70
Henderson-Hasselbalch-Gleichung 35-37
Hexamer 108
Hexanucleotid 108
Hind-III 102, 175
Homopolymer-Tailing 112, 120
Hybridisierung
- Bedingungen 202
- mit doppelsträngigen DNA-Sonden 208
Hydroniumion 32
Hydroxylion 32
Iin vitro-Transkription 124
in vitro-Translation 245
infective centers (IC) 82
Insert 180, 182, 184 f., 190
inverser Logarithmus 50
KKa 36
Kalorie 150
Kilo 12
Kilobase 13
kohäsive Enden 174, 180
Kolonien 38-40, 57 f., 199
Kommutativgesetz der Multiplikation 8-10
kompetitive PCR 161 f.
konjugierte Base 35 f.
konjugierte Säure 35 f.
Konzentrationsbestimmung
- Protein 225 f., 233
- einzelsträngige DNA 91-93
- doppelsträngige DNA 86
Korrelationskoeffizient 173, 215
Kriterien-Variable 166
Kürzen von Ausdrücken 12
Klonierung 71, 174 f., 195
Llag-Phase 44
Ligation 180, 182, 189
Lambdavektoren 182
- Plasmidvektoren 189
lineare Regression 166, 214
Logarithmus (log) 32-34, 45-47, 62 f., 139, 202
Luciferaseaktivität 244
In, natürlicher Logarithmus 62, 74, 159
log-Phase (Zellwachstum) 104, 236 f.
MM 13 71, 79, 92 f.
Markierung von DNA
mit Nick-Translation 106 -109
mit Random-Primern 108
mit Terminaler Transferase 112 f.
Markierung von Nucleinsäuren 103
Matrize 134-136, 161 f.
maximaler Radius (Rotor) 250 f.
Mega 12
metrische Vorsilben 1, 12 f.
Mikro 12
Mikroliter 12 f.
Milli 12
minimaler Radius (Rotor) 249
Mittelwert 58 f., 167 f.
mittlerer Radius (Rotor) 249
MOI 71, 75, 77, 82
Mol 12, 25
molarer Extinktionskoeffizient 226, 228
Molarität 26, 29-31, 98, 185, 230
- Umwandlung von Prozent 30
Molekülmasse (Molekulargewicht, MW) 25 f., 29, 31, 92, 98
Multiplikation 8 f., 19
Mutationsrate 61, 64
- Bestimmung durch Ausplattieren 79
- Bestimmung mit Fluktuationstest 62, 64
- Bestimmung mit Poisson-Verteilung 62, 64
MW (Molekulargewicht), siehe Molekülmasse
NNano 12
Nanogramm 12
natürlicher Logarithmus 62, 74, 159
Nearest-Neighbour-Wechselwirkungen 150-152
Nick-Translation 106-109
Nomogramm 251
Normalität 31
Nucleinsäuren 71, 85, 103, 127
- quantitative Bestimmung 231, 233
- Verunreinigungen 231, 233
OOD-Einheit 94, 128 f.
Oligonucleotide 94, 127 f., 203
- Konzentration 94-96
- quantitative Bestimmung 94
- Sonden 201-203
- Synthese 127 f.
ONP 236
ONPG 236
optische Dichte (OD) 38, 87, 94, 128
Oxidation 127, 244
PPCR, siehe Polymerasekettenreaktion
PCR-Zyklus 134, 136
PFU 79, 82 f., 187-189
Phagen 56, 71-84
Phage Lambda 71, 74, 79, 102, 180-182, 187-189
Phage Tl 56, 79
Phagenertrag 82
Phagentiter 79
Pico 12
pKa 35
Plaque 56, 79 f., 82, 199
plaque-forming unit (PFU) 79, 82 f., 187-189
[weiter lesen]